不限于是包括。不限于有递进的意思，例如这个博物馆对教师免费开放，不限于公办教师。句子前的是后面的充分条件关系。一般来说是写成“包括但不限于”，是指包括这些费用，但是由于有一些其他事项不能一一列举，所以是包括这些但不限于这些。包括但不限于意思是包含后面要说的内容，但是后面说的内容或许不全面，可能还有其他情况，所以是“不限于”。

包括但不限于是合同条款中常用的兜底术语，是不穷尽列举。而你的合同条款中“包括但不限于基本工资、加班工资、奖金等”，是指，除了列举的基本工资、加班工资、奖金，还不限于这些，可能还有其他的项目。