麦盖提县有1个镇、9个乡（2021年统计数据）。

麦盖提县位于新疆维吾尔自治区西南部，塔里木盆地西部，喀喇昆仑山北麓，叶尔羌河下游和提孜那甫河下游。

麦盖提县域属于叶尔羌河和提孜那甫河冲积扇形绿洲平原，地势平坦，总的地形是自西南向东北倾斜，一般地面坡度为1/2500～1/3500。在靠近沙漠边缘一带，地势起伏不平，荒地，沙丘交错。在灌区内地形地貌相差不大，地形坡降比较平缓。